pausa con jquery
HTML
<div id="test"></div>
CSS
#test{
width:100px; height:100px; background:green;
}
JavaScript
//función pause.
$.fn.pause = function(duration) {
$(this).animate({ dummy: 1 }, duration);
return this;
};
//llamamos a pause() y lo asociamos a #test dentro del evento ready() asociado a document.
$(document).ready(function(){
$("#test").pause(5000).fadeOut(240); // donde 1000 es igual a 1 segundo.
});