日付の文字列はsplitで分けなくてもそのままnew Dateに入れてgetTimeでミリ秒に変換可能

JavaScript

//日時を変数に入れる
var nowDateTime = "2012/09/17 22:00:00";

//日付と時間に分ける
var arr = nowDateTime.split(" ");

//年・月・日に分ける
var arrDate = arr[0].split("/");

//時・分・秒に分ける
var arrTime = arr[1].split(":"); 

//配列に分けた日時をnew Dateに入れる（月は-1）
document.write(new Date(arrDate[0], arrDate[1] - 1, arrDate[2],  arrTime[0], arrTime[1], arrTime[2]).getTime() + "<br>");

//実は文字列をそのまま入れても大丈夫！
//document.write(new Date(nowDateTime).getTime() + "<br>");