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function MyCtrl($scope) {
    // liste des patients, ceux présents ont inUnit à true
    $scope.patients = [
        {id:0,text:'Jean Dupont',inUnit:true},
        {id:1,text:'Charles Martin',inUnit:true},
        {id:2,text:'Hubert Jung'},
        {id:3,text:'Astrid Poitier'},
        {id:4,text:'Marie Vilard'},
        {id:5,text:'Gerard Jung'},
        {id:6,text:'Andre Martin'},
        {id:7,text:'Jean Benard'},
        {id:8,text:'Francis Ebani'},
        {id:9,text:'Roselyne Pinchon'},
        {id:10,text:'Olivier Paderan'}];
    // fonction pour détecter les patients présents
    $scope.isPatientInUnit = function(o) {return o.inUnit;};
    // récupération de la valeur sélectionnée
    $scope.selectedPatient;
}

// déclaration de la directive
angular.module('myApp', []).directive('finder', function ($timeout) {
    return {
        restrict:'E',
        replace:true,
        template:'<input type="hidden" style="width: 300px;"/>',
        // on récupére ici via les attributs du même nom les propriétés du scope parents
        // data <- patients
        // favorite <- isPatientInUnit
        scope: { data: '=', favorite: '='},
        link:function (scope, element, attrs, ctrl) {
            // affectation de select2 a la balise
            // on le met dans un timeout pour que 
            // l'affectation soit faire après la compilation AngularJS
            $timeout(element.select2({
                placeholder: "Rechercher un dossier",
                query: function (query) {
                    var results = {results: _.filter(scope.data,scope.favorite)};
                    if (query.term.length > 2) {
                        results.results = _.filter(scope.data,function(o) {return o.text.toLowerCase().indexOf(query.term) != -1;});
                    }
                    query.callback(results);
                }
            }),0);
            // mis à jour du modèle sur l'évènement 'change'
            element.bind("change", function(){
                scope.$parent[attrs.selection] = _.find(scope.data, function(o) { return o.id == element.val()});
                scope.$apply();
            });
        }
    }
})

<div ng-app="myApp">
  <div ng-controller="MyCtrl">
      <div>
          <finder data="patients" favorite="isPatientInUnit" selection="selectedPatient"></finder>
      </div>
    <br>
    <span>selection : {{selectedPatient.text}}</span>
  </div>
</div>