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$(function () {
    setTimeout('rect()'); //アニメーションを実行
});

function rect() {
    $('#rect').animate({
        marginTop: '-=10px'
    }, 800).animate({
        marginTop: '+=10px'
    }, 800);
    setTimeout('rect()', 1600); //アニメーションを繰り返す間隔
}

<div id="content">
    <div id="rect">box</div>
</div>

#rect {
    margin:100px auto 0;
    background:#87d3ff;
    width:100px;
    padding:20px;
    text-align:center;
    color:#fff;
}