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var $ = jQuery;

$(document).ready(function () {

  $('input[name="check-all"]').on('click', function() {
    $('input[type="checkbox"]').attr('checked', true).prop('checked', true).change();
  });

  $('input[name="uncheck-all"]').on('click', function(){
    $('input[type="checkbox"]').removeAttr('checked').prop('checked', false).change();
  });

  $('form').on('submit', function (){
    var $checkbox = $('input[name="alert-checkbox"]');
    alert(
      $checkbox.attr('checked') || $checkbox.prop('checked') ?
      'チェックしちゃいましたね。' : 'チェックしませんでしたね。'
    );

    return false;
  });

});

<form action="?" method="POST">
<p>
<label><input type="checkbox" name="checkbox1" value="1"> チェック1</label>　
<label><input type="checkbox" name="checkbox2" value="2"> チェック2</label>　
<label><input type="checkbox" name="checkbox3" value="3"> チェック3</label>　
<label><input type="checkbox" name="checkbox4" value="4"> チェック4</label><br>
<label><input type="checkbox" name="alert-checkbox" value="1"> これをチェックして送信するとアラートが出ます。</label>
</p>

<p>
<input type="button" name="check-all" value="全てのチェックを入れる">
<input type="button" name="uncheck-all" value="全てのチェックを外す">
</p>

<p>
<input type="submit" value="送信">
</p>

</form>